Una nueva plataforma molecular basada en CRISPR podría transformar el diagnóstico de la enfermedad pulmonar causada por micobacterias no tuberculosas (MNT), al identificar en pocas horas la especie responsable de la infección. El sistema, denominado CANDI (CRISPR, Assisted Nanodroplet Differential Identification), ha sido desarrollado por investigadores de la Universidad de Tulane y se describe en un estudio publicado en Science Translational Medicine. En una evaluación con 230 muestras clínicas, la tecnología identificó correctamente especies y subespecies de MNT con una precisión del 97,3 %, frente a las cuatro a seis semanas que puede requerir el procedimiento microbiológico convencional.
Un diagnóstico condicionado por el lento crecimiento bacteriano
Las MNT comprenden alrededor de 200 especies de micobacterias ambientales presentes fundamentalmente en suelo y agua, incluidos los sistemas domésticos de distribución. Aunque habitualmente no producen enfermedad en personas sanas, determinadas especies pueden provocar infecciones pulmonares crónicas de considerable gravedad.
El diagnóstico constituye uno de los principales problemas clínicos. Las micobacterias presentan un crecimiento lento y los métodos basados en cultivo pueden necesitar varias semanas antes de permitir la identificación del microorganismo.
Este retraso adquiere especial relevancia porque los síntomas pueden parecerse a los de la tuberculosis, incluyendo tos persistente, fatiga y deterioro respiratorio. Sin una identificación microbiológica adecuada, existe riesgo de confusión diagnóstica y de instaurar tratamientos que no se corresponden con la especie responsable.
Identificación simultánea de hasta 15 microorganismos
CANDI utiliza muestras de esputo y otros fluidos respiratorios para detectar simultáneamente hasta 15 especies y subespecies de MNT consideradas clínicamente relevantes.
La plataforma combina herramientas de reconocimiento molecular basadas en CRISPR con un sistema de nanogotas que permite realizar múltiples determinaciones dentro de una misma muestra. Su principal ventaja es proporcionar una identificación específica en cuestión de horas.
En el estudio, los investigadores analizaron 230 muestras clínicas. CANDI alcanzó una precisión del 97,3 % para identificar las especies y subespecies de micobacterias presentes, un rendimiento que plantea su posible utilidad como alternativa rápida o complemento a las técnicas microbiológicas convencionales.
La identificación de la especie condiciona el tratamiento
La diferenciación entre tuberculosis y enfermedad pulmonar por MNT tiene consecuencias terapéuticas directas. Los tratamientos difieren sustancialmente y, además, las distintas especies de MNT pueden presentar perfiles de susceptibilidad antimicrobiana diferentes.
Por ello, conocer rápidamente el microorganismo implicado puede facilitar una selección más precoz del régimen terapéutico y reducir tratamientos empíricos inadecuados o prolongados.
Esta necesidad es especialmente importante ante el aumento de las infecciones pulmonares por MNT. Según los investigadores, estas enfermedades han adquirido una prevalencia considerable en países desarrollados y pueden superar a la tuberculosis en determinados contextos epidemiológicos.
Mayor riesgo en pacientes vulnerables
Las consecuencias clínicas de estas infecciones son particularmente importantes en personas de edad avanzada, pacientes con enfermedades pulmonares estructurales y personas inmunodeprimidas, incluidos pacientes sometidos a determinados tratamientos oncológicos o personas con infección por VIH.
La enfermedad puede presentar una evolución crónica y requerir tratamientos prolongados con combinaciones de antimicrobianos. Los autores destacan una mortalidad a cinco años cercana al 18 %, aunque el pronóstico varía según la especie, las características del paciente, las comorbilidades y la extensión de la enfermedad.
Reducir el tiempo hasta la identificación microbiológica podría tener, por tanto, repercusiones tanto clínicas como psicológicas al acortar el periodo de incertidumbre diagnóstica.
Una plataforma con potencial más allá de las MNT
Los resultados publicados en Science Translational Medicine muestran un elevado rendimiento diagnóstico, pero todavía será necesario validar CANDI en poblaciones más amplias, diferentes laboratorios y escenarios clínicos antes de establecer su papel definitivo en la práctica asistencial.
Además, identificar una MNT en una muestra respiratoria no equivale necesariamente a diagnosticar enfermedad pulmonar activa. La interpretación debe integrarse con los criterios clínicos, radiológicos y microbiológicos establecidos, debido a la posibilidad de colonización o contaminación ambiental.
La tecnología presenta, sin embargo, una característica adicional: su diseño podría adaptarse para identificar simultáneamente múltiples bacterias responsables de otras infecciones. Si posteriores estudios confirman su rendimiento y viabilidad, las plataformas multiplexadas basadas en CRISPR podrían reducir sustancialmente los tiempos diagnósticos en enfermedades infecciosas en las que la identificación microbiológica convencional continúa siendo lenta.
Fuente: EuropaPress
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