COVIDome comparte datos de pacientes hospitalizados en tiempo real

COVIDome es una base de datos online para compartir información en tiempo real. Investigadores del Campus Médico Anschutz de la Universidad de Colorado (Estados Unidos) han creado un conjunto de datos multidimensionales, conocido ‘COVIDome’. La información procede de pacientes hospitalizados con COVID-19 frente a controles negativos. El equipo ha lanzado ahora un portal público a través de Internet para compartir esos datos en tiempo real.

Para crear el ‘COVIDome’, expertos en diferentes áreas de investigación biomédica crearon conjuntos de datos multidimensionales en sus laboratorios. Posteriormente, la información se recopiló y combinó para ser compartida a través del portal online.

COVIDome

Los conjuntos incluyen datos demográficos y clínicos, junto con un análisis emparejado del transcriptoma de la sangre completa, un análisis de los metabolomas del plasma y de los glóbulos rojos. Además, añade un fenotipo inmunológico profundo mediante citometría de masas y ensayos de seroconversión.

Así, para facilitar un acceso rápido y amplio al conjunto de datos ‘COVIDome’, cada conjunto de datos (después de la curación de datos y el control de calidad) está vinculado a nivel de muestra con un identificador único. Esto permite las referencias cruzadas entre plataformas. Además, el ‘COVIDome’ alberga seis paneles: Cohorte, Transcriptoma, Proteoma, Citocinas, Metaboloma y Mapas inmunológicos. Cada panel se ejecuta en su propio entorno aislado y protegido.

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