La necesidad de una respuesta rápida contra COVID-19 incitó a considerar diferentes fuentes para identificar compuestos bioactivos que pueden usarse como agentes terapéuticos. Es decir, incluidos los medicamentos y productos naturales disponibles.
En este contexto, un trabajo dirigido el catedrático Jaime Rubio Martínez, de la Facultad de Química y del Instituto de Química Teórica y Computacional (IQTC) de la Universidad de Barcelona, puede abrir nuevas perspectivas. El objetivo es diseñar nuevas estrategias terapéuticas en la lucha contra la COVID-19. Este nuevo avance científico se basa en el uso del cribado virtual (in silico). Se trata de una técnica de análisis computacional de moléculas almacenadas en bases de datos. Resulta clave para identificar y seleccionar compuestos naturales candidatos de potencial interés farmacológico.
El objetivo era identificar una serie de compuestos naturales que son capaces de inhibir la Mpro, la principal proteasa del virus SARS-CoV-2. La Mpro es una proteína no estructural que tiene un papel esencial en la replicación y la transcripción de este virus. Esta se considera una potencial diana terapéutica, ya que, si se pudiera inhibir, podría evitar la progresión del virus.
Análisis de compuestos naturales contra el SARS-CoV-2
El trabajo, publicado en la revista Journal of Chemical Information and Modeling, llevó a cabo un cribado virtual de la base de datos Selleck de productos naturales. Cabe recordar que esta biblioteca química cuenta con cerca de 2.000 compuestos. Todo ello para analizar diversas configuraciones de la proteasa Mpro del virus SARS-CoV-2, caracterizadas a partir de un estudio de dinámica molecular. Como resultado, el trabajo presenta en primer lugar la caracterización del perfil dinámico de la proteasa Mpro en la forma apo mediante simulaciones convencionales (cMD) y de dinámica molecular acelerada gaussiana (GaMD). De esta forma, define una serie de estructuras representativas. Estas estructuras se utilizaron posteriormente para llevar a cabo el ensamblaje molecular. Esto es, un método bioinformático que permite predecir y calcular con técnicas computacionales la posición más favorable de interacción entre un ligando y su proteína diana.
A continuación, se desarrolló un proceso iterativo con el que se incrementó la longitud de las cMD de los complejos proteína-ligando. Así, se calculó la energía libre de unión para seleccionar los candidatos más prometedores. Teniendo en cuenta los resultados, se seleccionaron once compuestos naturales. Los mismos se probaron in vitro por su capacidad de inhibir la proteasa Mpro. Por último, del conjunto final se identificaron cinco candidatos antivirales SARS-CoV-2, inhibidores de la proteasa Mpro, a partir de la base de datos de productos naturales.
The post Descubren compuestos naturales que inhiben la proteasa principal del virus SARS-CoV-2 appeared first on El médico interactivo.
from El médico interactivo https://ift.tt/lLiCgMo
0 comentarios:
Publicar un comentario